一、審查方式
臺美生態學校認證請至臺美生態學校夥伴網頁（網址：https://ecocampus.epa.gov.tw）提出申請，經初步審查及資料齊備且符合綠旗申請要件後，將安排委員到校審查。
二、生態學校必選環境路徑
自109學年度起（即自109年8月1日起）申請銀牌及綠旗認證（含再認證）時，應自交通、氣候變遷、消耗與廢棄物及永續食物等4項環境路徑中，至少擇1項執行。
三、受理綠旗認證申請及到校審查時程
自109年起以每年4月30日及9月30日為上、下半年之綠旗認證申請截止日，欲申請綠旗認證之學校，應於截止日前至臺美生態學校夥伴網頁提出並完成文件補正。
四、其他
認證通過之學校，行政院環境保護署將統一於年底進行表揚。